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    Anna DE FILIPPIS

    Insegnamento di MICROBIOLOGIA CLINICA

    Corso di laurea magistrale in BIOLOGIA

    SSD: MED/07

    CFU: 5,00

    ORE PER UNITÀ DIDATTICA: 40,00

    Periodo di Erogazione: Primo Semestre

    Italiano

    Lingua di insegnamento

    ITALIANO

    Contenuti

    Differenze tra procarioti ed eucarioti. Cellula procariotica: struttura e funzione, genetica, metabolismo e riproduzione. Coltura e identificazione dei principali microrganismi patogeni. Sterilizzazione e disinfezione. I vaccini. Virus: struttura, genetica, replicazione e classificazione. Principali batteri, virus, funghi e parassiti patogeni per l’uomo.

    Testi di riferimento

    1) Microbiologia farmaceutica - Carlone - Edises‎

    2) Principi di Microbiologia Medica - La Placa - Esculapio ed.

    Obiettivi formativi

    Il corso di microbiologia, rivolto agli studenti del secondo anno del corso di laurea, intende fornire le nozioni fondamentali della microbiologia focalizzandosi sia sugli aspetti generali della disciplina sia su quelli inerenti ai microrganismi patogeni dei quali saranno descritte le caratteristiche generali, la patogenesi e le patologie ad essi connesse. Al termine del corso, lo studente avrà acquisito
    conoscenze di base sui principali batteri, virus, parassiti e miceti,la loro patogenicità e sui mezzi per prevenire le infezioni. Lo studente sarà in grado di comprendere la complessa interazione microrganismi/ambiente e come i microrganismi patogeni possano superare i meccanismi di difesa dell’uomo causando malattia.

    Prerequisiti

    Conoscenze fornite dai corsi di Biologia Generale, Biochimica e Immunologia.

    Metodologie didattiche

    Il corso prevede la frequenza obbligatoria ed è articolato in 48 ore di lezioni frontali svolte dai docenti.

    Metodi di valutazione

    L’esame consiste nel superamento di una prova orale con votazione di almeno 18/30.
    Il colloquio si prefigge l’obiettivo di accertare le conoscenze dello studente sui principali argomenti in programma. Durante la prova orale sarà valutata la capacità di organizzare l’esposizione, la padronanza della materia attraverso la capacità di espressione e di collegamento tra i diversi argomenti del programma.

    Programma del corso

    Parte 1
    Generalità sui microrganismi: eucarioti, procarioti e virus.
    Batteriologia generale
    1 Cellula batterica
    • Dimensioni;
    • Forma;
    • Struttura della cellula batterica (nucleoide, citoplasma, membrana plasmatica, mesosomi, parete cellulare, strato mucoso, capsula, glicocalice, flagelli e ciglia, pili e fimbrie).
    2 Divisione cellulare (fissione binaria e tempo di generazione).
    3 Misurazione della crescita batterica (metodi diretti ed indiretti).
    4 Curva di crescita batterica.
    5 Strategia di sopravvivenza dei microrganismi (spora, fase L, biofilm, VBNC).
    6 Genetica dei microrganismi
    • Mutazioni;
    • Ricombinazione;
    • Meccanismi di trasferimento genico nei batteri (trasformazione, coniugazione);
    • Plasmidi;
    • Elementi trasponibili;
    • Batteriofagi (trasduzione e conversione fagica).
    7 Metabolismo batterico
    • Biosintesi macromolecolari nei batteri;
    • Nutrizione e crescita nei batteri ( fattori di crescita, condizioni fisiche e ambientali per la crescita microbica);
    • Fermentazione e produzione di biomasse;
    • Respirazione cellulare (condizioni di aerobiosi, condizioni anaerobiosi).
    8 Batteri patogeni per l’uomo e gli animale e fattori di virulenza. Patogenicità degli agenti infettanti:
    • Adesione e colonizzazione;
    • Invasione;
    • Moltiplicazione nell’ospite;
    • Resistenza alla fagocitosi;
    • Resistenza al complemento;
    • Esotossine;
    • Endotossine;
    • Mimesi molecolare.
    9 Coltivazione ed esame dei microrganismi:
    • Elementi necessari per la crescita;
    • Terreni di coltura;
    • Esame microscopico dei microrganismi;
    • Tecniche colturali e biochimiche di identificazione dei batteri;
    • Allestimenti di preparati per l’esame batterioscopico.
    Virologia generale
    1 Struttura, classificazione e caratteristiche dei virus.
    2 Coltivazione dei virus.
    3 Titolazione virale.
    4 Patogenesi virale.
    5 Difese immunitarie dell’ospite contro l’infezione virale.
    6 Strategie virali per eludere le difese immunitarie dell’ospite.
    7 Genetica virale.
    8 Batteriofagi.
    9 Virus oncogeni.
    10 Prioni.
    Parte 2
    1 Rapporti microrganismi/ospite
    • Flora microbica normale dell’organismo;
    • Microrganismi patogeni e fattori di virulenza;
    • Fonti di infezione e vie di trasmissione.
    2 Sterilizzazione
    • Metodi fisici;
    • Metodi chimici;
    • Controlli di sterilità.
    3 Disinfezione
    • Tipi di disinfettanti e meccanismi d’azione.
    4 Farmaci antivirali e relativi bersagli del ciclo replicativo
    5 Farmaci antibatterici
    • Classificazione degli antibiotici e meccanismo d'azione;
    • Meccanismi di resistenza.
    6 Diagnostica sierologica e molecolare
    7 Vaccini
    • Costituenti dei vaccini;
    • Classificazione dei vaccini.
    Batteriologia speciale
    Stafilococchi (Staphylococcus aureus, Stafilococchi coagulasi negativi e micrococchi); Streptococchi ed Enterococchi; Pneumococchi; Corynebacterium diphtheriae; Listeria monocytogens; Gardnerella vaginalis; Micobatteri (Micobacterium tubercolosis, Micobacterium leprae); Actinomiceti (Actinomices, nocardie e Streptomices); Neisserie (Neisseria meningitidis, Neisseria gonorrhoeae, Moraxelle); Enterobatteri (E.coli, Salmonella, Shigella, Klebsiella); Vibrio colerae; Campylobacter; Helycobacter Pylori; Yersinie; Bordetelle (Bordetella pertussis); Pseudomonas aeruginosa; Gram negativi non fermentanti (Acinetobacter, Flavobacterium); Gram negativi di incerta classificazione (Actinobacillus, Streptobacillus); Clostridi (Clostridium tetani, Clostridium botulinum); Chlamydie (Chlamydia trachomatis, Chlamydia pneumoniae ) e Micoplasmi (Mycoplasma pneumoniae e micoplasmi genitali).
    Virologia speciale
    Virus a DNA: Adenoviridae, Papillomaviridae, Herpesviridae, Poxviridae, Parvoviridae.
    Virus a RNA: Orthomyxoviridae, Paramyxoviridae, Picornaviridae, Reoviridae, Rhabdoviridae, Togaviridae, Coronaviridae, Arenaviridae, Flaviviridae, Filoviridae, Bunyaviridae. Virus a DNA o RNA che usano la trascrittasi inversa : Hepadnaviridae, Retroviridae.
    Micologia speciale
    Generalità, coltivazione, patogenesi delle micosi, micosi opportunistiche e primitive, diagnosi delle micosi. Miceti: Malesseziar furfur, Candida Albicans e spp, Cryptococcus neoformans, Aspergilli.
    Parassitologia speciale
    Nozioni generali di parassitologia, patogenesi e diagnosi. Parassiti di interesse medico: Ascaridi, Anchilostomi, Ossiuri, Tenia spp, Echinococcus Schistosoma, Fasciola spp, Protozoi patogeni: Trypanosomi, Leishmanie, Entamoeba Histolyca, Plasmodi, Toxoplasma gondii, Sarcocystis.

    English

    Teaching language

    Italian

    Contents

    Differences between prokaryotes and eukaryotes. Prokaryotic cell: structure and function, genetics, metabolism and reproduction. Culture and identification of the main pathogenic microorganisms. Sterilization and disinfection. Vaccines. Virus: structure, genetics, replication and classification. Main bacteria, viruses, fungi and parasites pathogenic for humans.

    Textbook and course materials

    1) Microbiologia farmaceutica - Carlone - Edises‎

    2) Principi di Microbiologia Medica - La Placa - Esculapio ed.

    Course objectives

    The microbiology course provides the fundamental notions of microbiology focusing both on the general aspects of the discipline and on those inherent to pathogenic microorganisms whose general characteristics, pathogenesis and pathologies will be described. At the end of the course, the students will have acquired
    knowledge of the main bacteria, viruses,parasites and fungi, their pathogenicity and on the means to prevent infections. The student will be able to understand the complex interaction between microorganisms / environment and how pathogenic microorganisms can overcome human defense mechanisms causing disease.

    Prerequisites

    Knowledge and skills provided by the General Biology, Biochemistry and Immunology.

    Teaching methods

    The course includes 48 hours of lectures, the attendance is mandatory.

    Evaluation methods

    The exam consists in passing an oral test with a vote of at least 18/30.
    The interview aims to ascertain the student's knowledge of the main topics of the program. During the oral exam the ability to discuss, explain and connect different topics of the program will be evaluated.

    Course Syllabus

    1) Part 1
    Introduction to microorganisms: eukaryotes, prokaryotes and viruses.
    General bacteriology
    1 Bacteria cell:
    size; morphology; structure (nucleoid, cytoplasm, plasma membrane, mesosome, cell wall, capsule, glycocalix, flagella, cilia, pili and fimbriae).
    2 Bacterial binary fission and generation time.
    3 Measurement of bacterial cell growth (direct and indirect methods).
    4 Bacterial growth curve.
    5 Bacterial survival strategies (spores, phase L, biofilm, VBNC).
    6 Genetics of microorganisms: mutations, ricombination, transformation, conjugation, transduction, plasmids, phages,transposable elements.
    7 Bacterial metabolism: macromolecules biosynthesis, growth factors, pH, temperature and oxigen requirements, fermentation,
    aerobic and anaerobic respirations.
    8 Pathogenic bacteria and virulence factors. Pathogenesis: adhesion, invasion, replication in host, resistance to phagocytosis and complement, exotoxins, endotoxins and molecular mimetism.
    9 Bacterial cell culture and examination: micro and macronutrients, culture media, microbial culture methods, identification methods.
    General virology
    1Generalities on viruses, morphology, structure, replication and classification.
    2 Techniques of virus cultivation.
    3 Viral titer.
    4 Virak pathogenesis.
    5 Immune defences against viral infections.
    6 Viral strategies of immune evasion.
    7 Viral genetics.
    8 Phages.
    9 Oncogenic viruses.
    10 Prions.
    Part 2
    1 Relations between microorganisms and hosts: normal microbial flora, pathogens and virulence factors, source and modes of transmission of infectious disease.
    2 Chemical and physical agents in the control of microorganisms.
    3 Antibacterial and antiviral chemotherapy.
    4Serological diagnostics and molecular diagnostics.
    5 Vaccines: components and classification.
    Special bacteriology
    Major bacteria of medical interest (Staphylococci, Streptococci, Mycobacteria, Neisseria, Helicobacter pylori, Enterobacteriaceae, Pseudomonas, Chlamidia, Rickettsia, etc)
    Special virology
    Major viruses of medical interest (Papillomaviridae, Herpesviridae, Orthomyxoviridae, Paramyxoviridae, Picornaviridae, Flaviviridae, Epadnaviridae, Retroviridae, etc.).
    Mycology
    General information, cultivation, pathogenesis of mycoses and diagnosis of mycoses. Mycetes of medical interest.
    Parasitology
    General notions of parasitology, pathogenesis and diagnosis. Parasites of medical interest.

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